MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei U32 chromosome

Total Repeats: 270788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014318	GCC	2	6	188398	188403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5002	NC_014318	GCC	2	6	188406	188411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5003	NC_014318	GCC	2	6	188465	188470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5004	NC_014318	GAC	2	6	188542	188547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5005	NC_014318	GGC	2	6	188553	188558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782111
5006	NC_014318	CGGGC	2	10	188562	188571	0 %	0 %	60 %	40 %	300782111
5007	NC_014318	CCG	2	6	188574	188579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5008	NC_014318	AGC	2	6	188603	188608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5009	NC_014318	CGA	2	6	188631	188636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5010	NC_014318	TGG	2	6	188639	188644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782111
5011	NC_014318	GCC	2	6	188661	188666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5012	NC_014318	TGC	2	6	188699	188704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5013	NC_014318	GCC	2	6	188707	188712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5014	NC_014318	CGC	2	6	188739	188744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5015	NC_014318	CG	3	6	188746	188751	0 %	0 %	50 %	50 %	300782111
5016	NC_014318	AGC	2	6	188765	188770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5017	NC_014318	CGC	2	6	188847	188852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5018	NC_014318	GCC	2	6	188929	188934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5019	NC_014318	CAG	2	6	188944	188949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5020	NC_014318	CGA	2	6	188952	188957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5021	NC_014318	CGA	2	6	188976	188981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5022	NC_014318	CGA	2	6	188991	188996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5023	NC_014318	GC	3	6	189003	189008	0 %	0 %	50 %	50 %	300782111
5024	NC_014318	CGG	2	6	189029	189034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782111
5025	NC_014318	AAC	2	6	189056	189061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300782111
5026	NC_014318	GCC	2	6	189064	189069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5027	NC_014318	CGA	2	6	189111	189116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782111
5028	NC_014318	AGG	2	6	189149	189154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300782111
5029	NC_014318	CGG	2	6	189203	189208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782111
5030	NC_014318	TGG	2	6	189236	189241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782111
5031	NC_014318	ACC	2	6	189245	189250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300782111
5032	NC_014318	GCC	2	6	189283	189288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5033	NC_014318	CGC	2	6	189317	189322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782111
5034	NC_014318	AAG	2	6	189587	189592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300782112
5035	NC_014318	GCC	2	6	189803	189808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782112
5036	NC_014318	GCT	2	6	189811	189816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782112
5037	NC_014318	GTC	2	6	189830	189835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782112
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5039	NC_014318	CGA	2	6	189976	189981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782112
5040	NC_014318	GTC	2	6	189982	189987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782112
5041	NC_014318	TCT	2	6	189999	190004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300782112
5042	NC_014318	GCT	2	6	190036	190041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782112
5043	NC_014318	GGC	2	6	190055	190060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782112
5044	NC_014318	TCG	2	6	190074	190079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782112
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5049	NC_014318	CGA	2	6	190219	190224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782112
5050	NC_014318	GTG	2	6	190273	190278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782112
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5052	NC_014318	GC	3	6	190336	190341	0 %	0 %	50 %	50 %	300782112
5053	NC_014318	CGT	2	6	190345	190350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782112
5054	NC_014318	TCG	2	6	190359	190364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782112
5055	NC_014318	GCG	2	6	190371	190376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782112
5056	NC_014318	GACGCC	2	12	190379	190390	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300782112
5057	NC_014318	CG	3	6	190394	190399	0 %	0 %	50 %	50 %	300782112
5058	NC_014318	CTG	2	6	190409	190414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782112
5059	NC_014318	CG	3	6	190474	190479	0 %	0 %	50 %	50 %	300782112
5060	NC_014318	GAG	2	6	190502	190507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300782112
5061	NC_014318	CGC	2	6	190606	190611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782112
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5064	NC_014318	GAC	2	6	190658	190663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782112
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5067	NC_014318	GCCGT	2	10	190745	190754	0 %	20 %	40 %	40 %	300782112
5068	NC_014318	CGA	2	6	190771	190776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782112
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5071	NC_014318	CGAC	2	8	190797	190804	25 %	0 %	25 %	50 %	300782112
5072	NC_014318	CG	3	6	190817	190822	0 %	0 %	50 %	50 %	300782112
5073	NC_014318	CGA	2	6	190840	190845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782112
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5085	NC_014318	TCG	3	9	191662	191670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782113
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5090	NC_014318	GCT	2	6	191870	191875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782113
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5093	NC_014318	GCA	2	6	191975	191980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782113
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5102	NC_014318	GC	3	6	192246	192251	0 %	0 %	50 %	50 %	300782113
5103	NC_014318	CGCAGC	2	12	192334	192345	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	300782113
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5107	NC_014318	GCCG	2	8	192705	192712	0 %	0 %	50 %	50 %	300782114
5108	NC_014318	CG	3	6	192733	192738	0 %	0 %	50 %	50 %	300782114
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5116	NC_014318	GCC	2	6	192949	192954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782114
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5120	NC_014318	GCG	3	9	193055	193063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782114
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5242	NC_014318	TCG	2	6	197478	197483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782120
5243	NC_014318	GTG	2	6	197492	197497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782120
5244	NC_014318	ACG	2	6	197511	197516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782120
5245	NC_014318	CCT	2	6	197527	197532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300782120
5246	NC_014318	CGA	2	6	197533	197538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782120
5247	NC_014318	CCTCGT	2	12	197539	197550	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	300782120
5248	NC_014318	GCA	2	6	197599	197604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782120
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5250	NC_014318	TCG	2	6	197673	197678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782120
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5252	NC_014318	ACG	3	9	197697	197705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782120
5253	NC_014318	CG	5	10	197714	197723	0 %	0 %	50 %	50 %	300782120
5254	NC_014318	GGC	2	6	197730	197735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782120
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5260	NC_014318	GCC	2	6	197869	197874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782121
5261	NC_014318	GCC	2	6	197887	197892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782121
5262	NC_014318	GCC	2	6	197900	197905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782121
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5264	NC_014318	GCA	2	6	197955	197960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782121
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5270	NC_014318	GGCC	2	8	198283	198290	0 %	0 %	50 %	50 %	300782121
5271	NC_014318	GTC	2	6	198293	198298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782121
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5273	NC_014318	GCC	2	6	198320	198325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782121
5274	NC_014318	CCGCA	2	10	198335	198344	20 %	0 %	20 %	60 %	300782121
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5278	NC_014318	CTG	2	6	198472	198477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782121
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5282	NC_014318	CGGG	2	8	198624	198631	0 %	0 %	75 %	25 %	300782121
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5290	NC_014318	ACG	2	6	198767	198772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782121
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5344	NC_014318	TCG	2	6	200691	200696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782123
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5348	NC_014318	CATCG	2	10	200771	200780	20 %	20 %	20 %	40 %	300782123
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5350	NC_014318	CTG	3	9	200923	200931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782124
5351	NC_014318	TCG	3	9	201053	201061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782124
5352	NC_014318	GCGA	2	8	201079	201086	25 %	0 %	50 %	25 %	300782124
5353	NC_014318	CCT	2	6	201123	201128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300782124
5354	NC_014318	CGT	3	9	201228	201236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782124
5355	NC_014318	CGG	2	6	201239	201244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782124
5356	NC_014318	GGCCTG	2	12	201253	201264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300782124
5357	NC_014318	GTG	2	6	201265	201270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782124
5358	NC_014318	CTG	2	6	201334	201339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782125
5359	NC_014318	GAC	2	6	201349	201354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782125
5360	NC_014318	CGA	2	6	201405	201410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782125
5361	NC_014318	ACG	2	6	201416	201421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782125
5362	NC_014318	AGGC	2	8	201446	201453	25 %	0 %	50 %	25 %	300782125
5363	NC_014318	CGG	2	6	201455	201460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782125
5364	NC_014318	GGT	2	6	201468	201473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782125
5365	NC_014318	CTG	3	9	201475	201483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782125
5366	NC_014318	CGAGC	2	10	201489	201498	20 %	0 %	40 %	40 %	300782125
5367	NC_014318	TGC	2	6	201521	201526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782125
5368	NC_014318	GC	3	6	201549	201554	0 %	0 %	50 %	50 %	300782125
5369	NC_014318	TGG	2	6	201569	201574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782125
5370	NC_014318	ACG	2	6	201674	201679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782125
5371	NC_014318	GGC	2	6	201703	201708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782125
5372	NC_014318	CG	3	6	201750	201755	0 %	0 %	50 %	50 %	300782125
5373	NC_014318	GGT	2	6	201756	201761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782125
5374	NC_014318	GCG	2	6	201785	201790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782125
5375	NC_014318	CGG	2	6	201803	201808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782125
5376	NC_014318	GCGG	2	8	201906	201913	0 %	0 %	75 %	25 %	300782125
5377	NC_014318	ACG	2	6	201917	201922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782125
5378	NC_014318	CG	3	6	202015	202020	0 %	0 %	50 %	50 %	300782125
5379	NC_014318	TGG	2	6	202058	202063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782125
5380	NC_014318	GC	3	6	202127	202132	0 %	0 %	50 %	50 %	300782125
5381	NC_014318	GGGC	2	8	202160	202167	0 %	0 %	75 %	25 %	300782125
5382	NC_014318	GAG	2	6	202192	202197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300782125
5383	NC_014318	CTGA	2	8	202230	202237	25 %	25 %	25 %	25 %	300782125
5384	NC_014318	TCAGC	2	10	202573	202582	20 %	20 %	20 %	40 %	300782126
5385	NC_014318	TGCG	2	8	202585	202592	0 %	25 %	50 %	25 %	300782126
5386	NC_014318	GCC	2	6	202595	202600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782126
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5389	NC_014318	G	6	6	202658	202663	0 %	0 %	100 %	0 %	300782126
5390	NC_014318	GCA	2	6	202671	202676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782126
5391	NC_014318	GCC	2	6	202690	202695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782126
5392	NC_014318	CAA	2	6	202705	202710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300782126
5393	NC_014318	CTT	2	6	202717	202722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300782126
5394	NC_014318	TCC	2	6	202727	202732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300782126
5395	NC_014318	CGC	3	9	202741	202749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782126
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5397	NC_014318	ATC	2	6	202796	202801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300782126
5398	NC_014318	CCG	2	6	202839	202844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782126
5399	NC_014318	CAG	2	6	202858	202863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782126
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5444	NC_014318	GTC	2	6	204742	204747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782127
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5450	NC_014318	GCT	2	6	204874	204879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782127
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5463	NC_014318	CGG	2	6	205382	205387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782128
5464	NC_014318	GCT	2	6	205445	205450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782128
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5466	NC_014318	GAC	2	6	205554	205559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782128
5467	NC_014318	GCCTC	2	10	205588	205597	0 %	20 %	20 %	60 %	300782128
5468	NC_014318	AAG	2	6	205635	205640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300782128
5469	NC_014318	CGG	2	6	205658	205663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782128
5470	NC_014318	CGA	2	6	205697	205702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782128
5471	NC_014318	GCT	2	6	205718	205723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782128
5472	NC_014318	GGCA	2	8	205757	205764	25 %	0 %	50 %	25 %	300782128
5473	NC_014318	GGC	2	6	205827	205832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782128
5474	NC_014318	CCG	2	6	205842	205847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782128
5475	NC_014318	GCT	2	6	205889	205894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782128
5476	NC_014318	GCG	2	6	205911	205916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782128
5477	NC_014318	CGT	2	6	205996	206001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782128
5478	NC_014318	GAC	2	6	206013	206018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782128
5479	NC_014318	CGACGG	2	12	206021	206032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	300782128
5480	NC_014318	CGG	2	6	206129	206134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782128
5481	NC_014318	GGC	2	6	206163	206168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782128
5482	NC_014318	TCG	2	6	206211	206216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782128
5483	NC_014318	GGT	2	6	206222	206227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300782128
5484	NC_014318	CGA	2	6	206243	206248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300782128
5485	NC_014318	GC	3	6	206339	206344	0 %	0 %	50 %	50 %	300782129
5486	NC_014318	GC	3	6	206353	206358	0 %	0 %	50 %	50 %	300782129
5487	NC_014318	TCG	2	6	206359	206364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782129
5488	NC_014318	CGGC	2	8	206365	206372	0 %	0 %	50 %	50 %	300782129
5489	NC_014318	CG	4	8	206401	206408	0 %	0 %	50 %	50 %	300782129
5490	NC_014318	GTC	2	6	206423	206428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782129
5491	NC_014318	CGAG	2	8	206431	206438	25 %	0 %	50 %	25 %	300782129
5492	NC_014318	GC	3	6	206460	206465	0 %	0 %	50 %	50 %	300782129
5493	NC_014318	GTC	2	6	206489	206494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782129
5494	NC_014318	CGGC	2	8	206503	206510	0 %	0 %	50 %	50 %	300782129
5495	NC_014318	CG	3	6	206517	206522	0 %	0 %	50 %	50 %	300782129
5496	NC_014318	CTT	2	6	206540	206545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300782129
5497	NC_014318	GCG	2	6	206555	206560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300782129
5498	NC_014318	TCG	2	6	206565	206570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300782129
5499	NC_014318	GC	3	6	206594	206599	0 %	0 %	50 %	50 %	300782129
5500	NC_014318	GCC	2	6	206602	206607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300782129

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